Con el crecimiento de la actividad comercial, agro-industrial, minera y las operaciones de la Banca; la falta de contadores en el Perú hace que se de la ley orgánica de Educación Pública Nº 9096 el primero de abril de 1941, creando los institutos superiores de Comercio, bajo el nombre de INSTITUTO SUPERIOR DE CIENCIAS SOCIALES.
El diputado por el Cusco en 1942 Dr. Roberto Garmendia hace consignar una partida de 18,000 soles en el Presupuesto Nacional de la República para la creación de un Instituto en la Universidad Nacional del Cusco.
El Consejo Universitario, en sesión del 18 de marzo de 1943, nombra la comisión compuesta por el Dr. Daniel Castillo y el Dr. César A. Muñiz, para que proponga los requisitos y condiciones para el funcionamiento del INSTITUTO SUPERIOR DE CIENCIAS COMERCIALES y el 19 de abril del mismo año, en sesión del consejo universitario, se aprueba el Plan Especial de Estudios y se crea dicho instituto, que empieza sus labores con 45 alumnos.

El 05 de julio de 1986 el Consejo Universitario acuerda crear la Facultad de Ciencias Contables y Financieras y el 13 de agosto del mismo año, se aprueba el proyecto del manual de Organizaciones y Funciones de la Facultad y el 21 de diciembre de 1987 se aprueba el nuevo balotario para los exámenes orales de grado.
La carrera profesional de Contabilidad, nace en abril de 1941 como INSTITUTO SUPERIOR DE CIENCIAS COMERCIALES y es creada para formar Contadores Públicos y a través de su trayectoria ha dado nacimiento a dos carreras  profesionales: primero ECONOMÍA y después  ADMINISTRACIÓN DE EMPRESAS, habiendo tenido una fructífera labor desde su creación.